Das Journal of Eye Diseases and Disorders betreibt ein doppelblindes Peer-Review-System. Unabhängige Forscher in verwandten Forschungsbereichen bewerten die Originalität, Gültigkeit und Relevanz der eingereichten Manuskripte, um Herausgebern bei der Entscheidung zu helfen, ob das Manuskript in der Zeitschrift veröffentlicht werden sollte. Das eingereichte Manuskript wird im Allgemeinen von zwei oder mehr Experten begutachtet, die gebeten werden, zu beurteilen, ob das Manuskript wissenschaftlich fundiert und konsistent ist, ob es mit veröffentlichten Arbeiten übereinstimmt und ob das Manuskript klar genug für eine Veröffentlichung ist.