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Abstrakt
Der Einfluss von Gefrier-Auftau-Zyklen auf die Integrität von SARS-CoV-2-Viruskulturflüssigkeiten und klinischen Restproben bei Antigen- oder Nukleinsäuretests
Hajirah Noor Hussain, Hali Weeks, Derek Zhou, Divya Joseph, Brooke Lam, Haidong Xu, Chushi Zhang, Keqin Gregg, Wenli Zhou*
Die Konservierung bei ultraniedrigen Temperaturen ist ein Goldstandard für die Langzeitlagerung vieler Arten klinischer Proben, einschließlich des SARS-CoV-2-Virus. Die gefrorenen Proben können problemlos transportiert und später getestet werden. Darüber hinaus sind anonymisierte gefrorene Restproben eine Ressource für viele präklinische oder klinische Studien. Daher ist es von entscheidender Bedeutung zu verstehen, ob Gefrier-Auftau-Zyklen (FTCs) die Testleistung auf SARS-CoV-2 negativ beeinflussen können, wenn gefrorene Proben getestet werden. Einige frühe Studien deuten darauf hin, dass FTCs den Zyklusschwellenwert (Ct) der Reverse-Transkriptase-Echtzeit-PCR (RT-PCR oder RT-qPCR) erhöhten, was auf einen möglichen Abbau der SARS-CoV-2-Nukleinsäure nach FTCs hindeutet, während die anderen Studien keine signifikanten Veränderungen der SARS-CoV-2-Nukleinsäuren nach FTCs berichteten. Darüber hinaus wird über die Auswirkungen von FTCs auf die Leistung des SARS-CoV-2-Antigentests kaum berichtet.
In dieser Studie führten wir gepaarte Nukleinsäure- und schnelle Antigentests an denselben Proben durch, um zu untersuchen und direkt zu vergleichen, wie sich FTCs auf die Leistung zweier Testarten auswirken. Es wurden sowohl Proben inaktivierter Viruskulturflüssigkeit als auch klinische Restproben untersucht. Unsere Ergebnisse zeigten, dass FTCs nur minimale negative Auswirkungen auf die Leistung des schnellen SARS-CoV-2-Antigentests hatten und die Testergebnisse über alle FTCs hinweg weitgehend konsistent blieben, während die Ct-Werte der RT-PCR mit der Zunahme der FTC-Anzahl anstiegen. Darüber hinaus zeigten unsere Daten auch, dass SARS-CoV-2 bei FTCs in Bezug auf Nukleinsäuretests im viralen Transportmedium (VTM) besser konserviert wird als in phosphatgepufferter Salzlösung (PBS).