Gomase VS, Chitlange NR, Sherkhane AS, Changbhale SS und Kale KV
Wuchereria bancrofti ist ein fadenförmiger Fadenwurm und einer der Erreger der lymphatischen Filariose, bei der die
Lymph- und Geschlechtsorgane vorübergehend oder dauerhaft geschädigt werden. Bis heute wurde kein wirksames Medikament oder Impfstoff zur Behandlung der lymphatischen Filariose entdeckt. In dieser Analyse haben wir antigene Peptide aus dem Troponinprotein von Wuchereria bancrofti für die Entwicklung eines synthetischen Peptidimpfstoffs gegen lymphatische Filariose vorhergesagt, da mit einer einzigen Proteinuntereinheit eine Immunantwort in einer großen Population erzeugt werden kann. Die Analyse zeigt, dass vorhergesagte Epitope des Troponinproteins von Wuchereria bancrofti wichtige Determinanten für den Schutz vor lymphatischer Filariose sind. In diesem Test haben wir die Bindungsaffinität des Troponinproteins von Wuchereria bancrofti analysiert, das 136 Aminosäuren aufweist und 128 Nonamere aufweist. In dieser Forschungsarbeit haben wir CTL-Epitope mit zwei verschiedenen Methoden vorhergesagt, nämlich SVM (Support Vector Machine) und ANN (Artificial Neural Network). Die auf SVM basierende Vorhersage ergab sechzehn gültige Epitope mit einem optimalen Score von 1,129 bei einem Cut-off von 0,36, während die auf ANN basierende Vorhersage einunddreißig gültige Epitope mit einem optimalen Score von 1.000 bei einem Cut-off von 0,51 ergab. Wir haben außerdem kaskadenförmige SVM-basierte TAP-Binder und vier potenzielle antigene Epitope vorhergesagt, nämlich 31-LRKLIRK-37, 49-DEFCALVYTVANT-61, 87-SRPTLKALLKE-97, 108-EAAVDE-113 (optimale Neigung 1,223), vorhergesagt auf der Basis der höchsten lokalen Hydrophilie; Darüber hinaus haben wir auch die Tertiärstruktur der beiden längsten potenziellen Epitope experimentell vorhergesagt, was unser Verständnis der
Sequenz-Struktur-Funktionsbeziehung des Troponinproteins von Wuchereria bancrofti bei der Entwicklung synthetischer Peptidimpfstoffe unterstützen kann. So kann ein kleines Fragment des Troponinproteins eine Immunreaktion gegen die Aktivität von Wuchereria bancrofti hervorrufen. Dieser Ansatz kann für die Entwicklung von Untereinheiten- und synthetischen Peptidimpfstoffen angewendet werden.