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Abstrakt
Vorhersage von Mikro-RNAs gegen H5N1- und H1N1-NS1-Protein: ein Fenster zur sequenzspezifischen Therapeutikaentwicklung
Pankaj Koparde und Shailza Singh
Motivation: Konventionelle Grippemedikamente können aufgrund der stark variablen Natur der Grippeantigenproteine versagen. Die In-silico-Vorhersage sequenzspezifischer Therapeutika ist weniger zeitaufwändig und kostengünstig. Die meisten miRNA-Zielvorhersageplattformen unterscheiden sich in ihrer Spezifität und Sensitivität bei der Vorhersage. Hier schlagen wir einen bioinformatischen Ansatz zur Vorhersage von Mikro-RNAs gegen das nichtstrukturelle Protein 1 des Vogelgrippevirus H5N1 und gegen Segment 8 des Schweineinfluenzavirus H1N1 vor.
Ergebnisse: hsa-miR-138, hsa-miR-525-5p und hsa-miR-124 wurden als mögliche sequenzspezifische Therapeutika gegen das NS1-Protein des H5N1-Virus ausgewählt. Ähnliche Studien an verschiedenen Genomen des H1N1-Segments 8 führten zur Vorhersage von miRNAs, die als Mittel gegen Grippe eingesetzt werden können. Die vorhergesagten Mikro-RNAs spielen auch eine Rolle in Regulierungsprozessen der Wirtszelle, in stressbedingten Signalwegen, einschließlich des MAPK-Signalwegs und des mTOR-Signalwegs, und sind offenbar an Signalwegen beteiligt, die mit Krebs in Zusammenhang stehen.