Zeitschrift für Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrakt

Vorhersage von Genom- und Proteinstrukturen des Homo Sapiens Neanderthalensis mit NCBI-Tools

Rakesh Medarametla*, Lavanya Rao, Kishore Bejugam

 Das Nationale Zentrum für biotechnologische Informationen (NCBI) ist Teil der Vereinigten Staaten von Amerika. Die Rolle in Forschung und Bildung speziell zu grundlegenden molekularen und genetischen Prozessen, die Gesundheit und Krankheit steuern, wird von der National Library of Medicine (NLM) NCBI übernommen. Eine Einführung in die NCBI-Datenbanken und -Karten hilft Forschern bei der Auswahl von Werkzeugen, die bei der Suche nach Sequenzen hilfreich sein können. Ein besonders hilfreiches Feature ist der Science Primer, der eine leicht lesbare Einführung in viele wissenschaftliche Themen bietet, die für die NCBI-Ressourcen relevant sind, wie Bioinformatik, Molekularmodellierung, Genomkartierung und Molekulargenetik. Der Versuch, das gesamte Genom zu sequenzieren, erhöht die Anzahl der Proteinsequenzen jedes Jahr um den Faktor zwei, die Lücke zwischen Sequenz- und Strukturinformationen, die in öffentlichen Datenbanken gespeichert sind, wächst schnell. Im Gegensatz zu Sequenzierungstechniken ist eine experimentelle Methode zur Strukturbestimmung sehr zeitaufwändig und in ihrer Anwendung begrenzt. Daher kann sie mit der Flut neu charakterisierter Genprodukte nicht Schritt halten. Die Entwicklung praktischer Methoden zur Vorhersage der Proteinstruktur aus der Sequenz ist daher im Bereich der Biologie von erheblicher Bedeutung.