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Abstrakt
Vorhersage der 3D-Struktur des paralytischen insektiziden Toxins (ITX-1) von Tegenaria agrestis (Hobospinne)
AGIngale und NJChikhale
Paralytisches insektizides Toxin (ITX-1) (Tegenaria agrestis) enthält mehrere antigene Komponenten, um das Immunsystem zu lenken und zu stärken, damit es den Wirt vor Infektionen schützen kann. Spinnenpeptidtoxine mit nanomolarer Affinität zu ihren Rezeptoren sind vielversprechende pharmakologische Werkzeuge zum Verständnis der physiologischen Rolle von Ionenkanälen und als Anhaltspunkte für die Entwicklung neuer therapeutischer Wirkstoffe und Strategien für ionenkanalbedingte Krankheiten. Für das paralytische insektizide Toxin (ITX-1) von Tegenaria agrestis (Hobospinne) wurde ein dreidimensionales Modell (3D) entwickelt. Zur Vorhersage der Struktur wurde eine Homologiemodellierungsmethode verwendet. Für die Modellierung wurde mittels mGenTHERADER ein Vorlagenprotein erhalten, nämlich die hochauflösende Röntgenkristallographiestruktur eines FERREDOXINS (1FCA) von Clostridium acidurici. Durch Vergleich des Vorlagenproteins wurde mithilfe von MODELLER, einem Programm zur vergleichenden Modellierung, ein grobes Modell für das Zielprotein erstellt. Das Modell wurde mit Proteinstrukturprüftools wie PROCHECK und WHAT IF auf Zuverlässigkeit validiert. Die so diskutierten Informationen liefern Einblicke in das molekulare Verständnis des paralytischen Insektizidtoxins (Tegenaria agrestis). Das vorhergesagte 3D-Modell kann weiter zur Charakterisierung des Proteins im Nasslabor verwendet werden.