Om AD *, Sharif S, Jasmani S, Sung YY, Bolong AA
Die Vitellogenin (Vtg)-Gensequenz fungiert als Indikator für die Fischreproduktion, die sich an Umweltfaktoren anpassen oder die Gonadenentwicklung beeinflussen kann. Die Vtg-Nukleotidsequenz des Riesenzackenbarsches wurde mithilfe einer Bioinformatik-Software charakterisiert. Mithilfe der Website des National Centre for Biotechnology Information wurde eine Homologiesuche der abgeleiteten Aminosäuresequenz der erhaltenen Vtg-DNAs (Vergleich mit 13 Arten) durchgeführt. Mittels Clustal-W-Analyse wurde mithilfe von Molecular Evolutionary Genetic Analysis MEGA Version 5.2.2 ein phylogenetischer Baum erstellt. Um die erhaltenen Vtg-Gensequenzen zu verifizieren und die Struktur-Funktions-Beziehung in Vtg aufzuklären, wurde DELTA BLAST der 3D-Struktur des Riesenzackenbarsches mit anderen Fischen verwendet. Die Ergebnisse der phylogenetischen Analyse mithilfe von Maximum Likelihood (ML) und Neighbour Joining (NJ) zeigten, dass die Baumanalyse zwei getrennte Baumtopologien generierte. Diese Ähnlichkeit (0,015 Distanz, Matric Viewer) war hinsichtlich ihrer Vtg-Gensequenz eng verwandt, obwohl sie aus unterschiedlichen Umwelt- und ökologischen Bedingungen stammten. Generell zeigte sich, dass Epinephelus lanceolatus Vtg evolutionär stärker mit Poecilia latipinna verwandt ist. Epinephelus lanceolatus weist vier Hauptdomänen auf (Vitellogenin-N, DUF1943, DUF1944 und VMD), die ähnlich bei Dicentrachus labrax zu finden sind, sich aber von Clarias macrochepalus, Catla catla und Danio rerio unterscheiden. Dies weist darauf hin, dass die Vtg-Domäne für Süßwasserarten charakteristisch ist und durch das Vorhandensein von VMD in Vtg gesteuert wird. Der molekulare Ansatz kann bei Riesenzackenbarschen durchgeführt werden, um die molekulare Reaktion auf das Fischwachstum zu verstehen und das Individuum des Riesenzackenbarsches zu bestimmen, das das Potenzial hat, die Vtg-Produktion zu steigern und damit die Eierqualität zu verbessern.