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Abstrakt
In Silico Funktionale Vorhersage und Expressionsanalyse der Genfamilie des Natural Resistance-Associated Macrophage Protein ( NRAMP ) in Mais als Reaktion auf Trockenstress
Md. Golam Rabby, Md. Mostafa Kamal, Md. Sakib Hasan, Md. Mossabbir Hossain, Md. Numan Islam*
Natürliche Resistenz-assoziierte Makrophagenproteine ( NRAMPs ) fungieren in Pflanzen als Metallübergangstransporter zur Aufrechterhaltung der Metallhomöostase. Die genomweite Identifizierung und funktionelle Vorhersage der Mais- NRAMPs wurden noch nicht untersucht. Die genomweite Analyse identifizierte sieben Proteine (ZmNRAMP1, ZmNRAMP2, ZmNRAMP3, ZmNRAMP4, ZmNRAMP5, ZmNRAMP6, ZmNRAMP7 ) in Mais mit einem Molekulargewicht von 29,08 ( ZmNRAMP2 ) bis 63,20 ( ZmNRAMP5 ) kDa. Mit Ausnahme von ZmNRAMP1 und ZmNRAMP3 sind alle ZmNRAMPs essentielle Proteine (isoelektrische Punkte größer als 7). Die Anzahl der Introns in ZmNRAMPs variiert von 1 bis 13, was innerhalb der phylogenetischen Gruppen (A und B) zwischen Mais und Arabidopsis nahezu einheitlich ist. Alle Proteine zeigten mehrere Motive (zwischen 6 und 10), die zwischen den Gruppen von Mais und Arabidopsis konsistent waren. Wir führten auch Transmembrandomänen, cis-regulatorische Elemente, Chromosomenkartierung und Genontologie-Annotation durch, die signifikante funktionelle Eigenschaften offenbarten. Eine signifikant erhöhte Expression von ZmNRAMPs ( ZmNRAMP1, ZmNRAMP2 und ZmNRAMP4 ) in vegetativen und reproduktiven Geweben könnte eine wesentliche Rolle bei der Aufnahme, dem Transport und der Homöostase von Schwermetallen spielen. Während Dürrestress könnte eine signifikante Hochregulierung von cc ( ZmNRAMP1, ZmNRAMP2, ZmNRAMP4 und ZmNRAMP7 ) eine Rolle bei der Dürretoleranz oder Akklimatisierung von Mais spielen.