Zeitschrift für Stammzellforschung und -therapie

Abstrakt

Genomweite Massensequenzierung in der embryonalen Stammzellbiologie: Neue Erkenntnisse und Herausforderungen

Yaofeng Wang, Alex Chun Cheung, Jun-Tao Guo und Bo Feng

Die Entdeckung pluripotenter embryonaler Stammzellen (ESCs) in Säugetieren hat die Stammzellenforschung und regenerative Medizin grundlegend verändert. Um den molekularen Mechanismus der Pluripotenz zu verstehen, wurden Massensequenzierungstechnologien mit großem wissenschaftlichen Interesse eingesetzt, da sie Vorteile wie hohe Auflösung, geringes Rauschen sowie eine umfassende Abdeckung des gesamten Genoms bieten. Hier überprüfen wir die Prinzipien genomweiter Massensequenzierungstechnologien, die häufig in ESC-Studien eingesetzt werden, darunter ChIP-Seq, RNA-Seq und MethylCSeq. Jüngste Verbesserungen und Anwendungen dieser Technologien werden ebenfalls diskutiert. Darüber hinaus wird eine Zusammenfassung verschiedener Methoden zur Integration der massiven genomweiten Sequenzierungsdaten präsentiert. Die Integration der massiven Daten, die verschiedene Aspekte von ESCs beschreiben, kann zahlreiche Innovationen zum Verständnis der Transkriptionsnetzwerke bei der Aufrechterhaltung der Pluripotenz sowie der Genregulationen und epigenetischen Modifikationen in ESCs anregen, die für Forschung und klinische Anwendungen wichtig sind. Darüber hinaus heben wir die Merkmale hervor, denen die Aufmerksamkeit von Biologen aufgrund der aktuellen Herausforderungen bei der Analyse massiver Sequenzierungsdaten in der Bioinformatik und Biostatistik würdig ist.