Zeitschrift für Aquakulturforschung und -entwicklung

Abstrakt

Vergleichende Analyse der genetischen Vielfalt in natürlichen Populationen von Labeo rohita und Cirrhinus marigala unter Verwendung artspezifischer molekularer Marker

Faisal Tasleem*, Shahid M, Hina Fatima, Numan Gulzar M

Labeo rohita , allgemein bekannt als Rohu, und Cirrhinus marigala , im Volksmund als Morakkha bekannt, sind die wirtschaftlich bedeutendsten und am häufigsten gezüchteten Fischarten auf dem gesamten indischen Subkontinent. Eine genetische Bewertung dieser Arten ist für ihre ordnungsgemäße Überwachung, Erhaltung und rentable Produktion erforderlich. Es stehen verschiedene Arten molekularer Marker zur Verfügung, aber SSR sind aufgrund ihrer gleichmäßigen Verteilung, Häufigkeit im Genom, Kodominanz, Polymorphie, kostengünstigen Erkennung und multiallelischen Natur der wichtigste. Für diese Studie wurden zehn Proben jeder Art in den Regionen Head Punjnad, Head Muhammad Wala und Head Trimmu des Flusses Chenab in Pakistan gesammelt. Nach der Extraktion der DNA, der Amplifikation von fünf einfachen Sequenzwiederholungsmarkern, ihrer Auflösung auf PAGE und der allelischen Bewertung der genotypischen Daten wurden mithilfe von POPGENE Version 1.32, FSTAT Version 2.9.3.2, dem Ähnlichkeitskoeffizienten von Jaccard und Dice, einer einfachen Matching-Analyse und dem SIMQUAL-Programm des NTSYS-PC-Pakets verschiedene Indizes zur genetischen Diversitätsanalyse analysiert.

Bei Labeo rohita wurden insgesamt 26 Allele mit 260 Loci nachgewiesen, von denen 189 polymorph waren. Der Polymorphismus für die fünf Marker variiert von 43,33 % bis 96 % bei einem Mittelwert von 72,69 %. Die Allelfrequenz reicht von 0,2000 bis 0,9000 mit einem Mittelwert von 0,4600, die Allelzahlen variieren von 4.000 bis 9.000 mit einem Durchschnittswert von 5,2000, die Gendiversität variiert von 0,1800 bis 8800 mit einem Mittelwert von 0,6360 und der PIC-Wert reicht von 0,1638 bis 0,8680 mit einem Mittelwert von 0,6012. Der paarweise genetische Unterschied zwischen zehn gesammelten Proben variiert von 0,400 bis 0,900, während die paarweise genetische Ähnlichkeit von 0,100 bis 1.000 reicht. Eine Clusteranalyse basierend auf UPGMA hat zehn Proben von Labeo rohita in drei Cluster und drei Subcluster unterteilt. Ebenso zeigen fünf SSR-Marker von Cirrhinus marigala 30 Allele mit 300 Loci in zehn Proben mit 240 polymorphen Loci. Der Polymorphismus reicht von 70 % bis 96 % mit einem Durchschnittswert von 80 %. Die Allelfrequenz variiert von 0,4000 bis 0,9000 mit einem Durchschnittswert von 0,6600. Die Allelzahlen variieren von 4.000 bis 9.000 mit einem Mittelwert von 6.000. Die Gendiversität variiert von 0,1800 bis 0,7800 mit einem Mittelwert von 0,4680. Der PIC-Wert reicht von 0,1638 bis 0,7578 mit einem Mittelwert von 0,4422. Die paarweise genetische Differenz zwischen zehn Proben von Cirrhinus marigala liegt zwischen 0,2000 und 0,800 und die paarweise Ähnlichkeit zwischen 0,200 und 1,000. Die Clusteranalyse auf Basis von UPGMA hat alle Proben von Cirrhinus marigala in drei Cluster und drei Untercluster unterteilt. Diese Studie zeigt, dass die pakistanische Regierung und interessierte Stellen ernsthafte Schritte zur Verbesserung der genetischen Struktur dieser Arten, insbesondere von Cirrhinus marigala, unternehmen sollten .