Kejue Jia und Robert L. Jernigan
Mit der Entwicklung von Hochdurchsatz-, Next-Generation-Sequencing- und anderen fortschrittlichen Technologien wurden zahlreiche Genexpressionsprofile erstellt. Viele dieser Profile sind in öffentlichen Datenbanken verfügbar [1-3]. Ein anspruchsvolles Forschungsproblem, das in der Vergangenheit viel Aufmerksamkeit auf sich gezogen hat, ist die Ableitung von Genregulationsnetzwerken aus den Expressionsdaten. Ein Genregulationsnetzwerk wird durch einen gerichteten Graphen dargestellt, in dem Knoten Transkriptionsfaktoren oder mRNA darstellen und Kanten transkriptionelle regulatorische Beziehungen zwischen zwei Knoten anzeigen.