Zeitschrift für Aquakulturforschung und -entwicklung

Abstrakt

Charakterisierung der prokaryotischen und eukaryotischen mikrobiellen Gemeinschaft in Teichen mit Pazifischen Weißen Garnelen

Dongwei Hou, Shenzheng Zeng, Jian Liu, Muting Yan, Shaoping Weng, Jianguo He Jianguo He und Zhijian Huang

Diese Forschung untersucht die Gemeinschaftszusammensetzungen und dominanten Taxonomien prokaryotischer und eukaryotischer Mikroben in 30 Wasserproben aus 5 verschiedenen Teichen für weiße Garnelen im Pazifik. Die V4-Region des 16S rRNA-Gens und des 18S rRNA-Gens wurde mithilfe einer Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologie sequenziert. Insgesamt wurden 1.387.317 16S rRNA- und 1.612.056 18S rRNA-Genfragmente zur Klassifizierung ausgewählt, darunter 3.841 prokaryotische Operational Taxonomic Units (OTUs) und 990 eukaryotische OTUs. Es wurde beobachtet, dass alle 16S rRNA-Sequenzen mit mindestens 47 Bakterienabteilungen und 18S rRNA-Sequenzen mit 50 eukaryotischen Abteilungen verbunden waren. Unter allen 30 Proben wiesen die dominanten prokaryotischen und eukaryotischen Gemeinschaften auf Phylumebene erhebliche Ähnlichkeiten in der Zusammensetzung auf, jedoch nicht in der Häufigkeit. Die dominante prokaryotische Gemeinschaft umfasste Actinobacteria, Proteobacteria, Cyanobacteria, Planctomycetes, Verrucomicrobia, Bacteroidetes, Chlorobi, Chloroflexi, Firmicutes und Spirochaetes. Cercozoa, Chlororhyta, Arthropoda, Stramenopiles (nicht identifiziert), Fungi (nicht identifiziert), Prymnesiophyceae, Ciliophora, Mollusca, Choanomonada und Jakobida waren die dominanten Zusammensetzungen der eukaryotischen Gemeinschaften. Ebenso gab es auf Gattungsebene signifikante Unterschiede zwischen den 30 Proben. Ergebnisse zu Reichtum und Vielfalt zeigten, dass prokaryotische und eukaryotische Mikroben in 5 Teichen komplexe Gemeinschaftszusammensetzungen besaßen. Während der verschiedenen Zeiträume und verschiedenen Teiche unterschieden sich die Werte des Chao-, Ace-, Shannon- und Simpson-Index nicht signifikant (P > 0,05).