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Abstrakt
Versuch einer Validierung von Kinesin-Biomarkern auf Basis oberflächenverstärkter Laserdesorptions-Ionisation und Flugzeit bei malignem Mesotheliom
Stephen M. Brindley, Brian C. Tooker, Harvey I. Pass und Lee S. Newman
Mithilfe der oberflächenverstärkten Laserdesorptions-/Ionisations-Flugzeit-Massenspektrometrie (SELDI-TOF) können Forscher Proteome nach Krankheitsbiomarkern durchsuchen. Die Validierung der SELDI-TOF-Ergebnisse mit herkömmlichen Methoden hat gemischte Ergebnisse erbracht. Echtzeit-PCR-, ELISA- und Western-Blot-Tests wurden eingesetzt, um den Zusammenhang zwischen asbestbedingten Krebserkrankungen und den Proteinen der Kinesinfamilie, KIF5A und KIF18A, zu bestätigen. Diese Proteine wurden mithilfe von SELDI-TOF und Klassifikations- und Regressionsbaumanalyse (CART) im Serum von Patienten mit asbestbedingten Krebserkrankungen identifiziert. Als gut charakterisierte Asbestfasern verwendet wurden, um Mesothelzelllinien zu testen, wurden gemischte Ergebnisse bei der RNA-Expression von KIF5A und KIF18A beobachtet. Western-Blot-Analysen, bei denen die Proteinspiegel in Mesotheliomzelllinien mit transformierten Mesothelzellen verglichen wurden, ergaben keine eindeutigen Ergebnisse. Dies galt auch für Western-Blot-Analysen von menschlichem Mesotheliom und nicht-krebsartigem Peritoneum, die von denselben Patienten gewonnen wurden. Diese Ergebnisse legen nahe, dass die durch SELDI-TOF CART nachgewiesenen Proteine der Kinesinfamilie wahrscheinlich nicht als Biomarker für bösartiges Mesotheliom geeignet sind.