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Abstrakt
Eine erweiterte Analyse von SARS-CoV-2 mithilfe eines nichtlinearen dynamischen chaotischen Modells
Lin Fang, Xinlei Wang, Zhongyuan Lai, Dongdong Zhang, Mengqu Wu, Zhirui Pan, Li Wang, Kun Tang, Dahong Qian, Zhende Huang, Xudong Wang, Haibo Chen
Das zweidimensionale Bild zellulärer Automaten (CA) ist eine alternative Methode zur Darstellung der Nukleotid- und Aminosäuresequenzen. Hier haben wir gezeigt, dass die zweidimensionalen CA-Bilder die Nukleotidsequenzen (Basensequenz) des Gens und der Genome von SARS-CoV-2, dem Krankheitserreger der COVID-19-Pandemie, anschaulich darstellen können. Wenn die genetischen Codon-Regeln strikt eingehalten werden, können die CA-Bilder auch die genetischen Codons darstellen und indirekt die Aminosäuresequenzen der Proteine von SARS-CoV-2 ausdrücken. CA-Bilder können die allgemeinen und detaillierten Unterschiede zwischen Nukleotid- oder Aminosäuresequenzen aufzeigen und reagieren sehr empfindlich auf Sequenzdetails wie die Spalterkennungsstelle der Wirtsprotease wie TMPRSS2 und die Rezeptorbindungsdomäne (RBD) des Spike-Proteins von SARS-CoV-2, die sogar auf Änderungen nur einer Aminosäure oder eines Nukleotids zwischen den Sequenzen verschiedener SARS-CoV2-Stämme empfindlich reagieren. Wir glauben, dass CA-Bilder eine mathematische Grundlage für virale genetische und Aminosäuresequenz-Nachrichten liefern oder bei der Darstellung der genetischen Nachrichten von SARS-CoV2 und anderen Viren auf künstliche Intelligenz angewendet werden können.