Xiaohui Chen Nielsen, Derya Carkaci, Rimtas Dargis, Lise Hannecke, Ulrik Stenz Justesen, Michael Kemp, Jens Jørgen Christensen und Monja Hammer
Die Arten, die Katalase-negative, grampositive Kokken sind und nicht zu den Streptokokken oder Enterokokken gehören, sind zunehmend besser charakterisiert, und die Zahl der taxonomischen Einheiten wächst aufgrund molekulartaxonomischer Studien stetig. Dies erschwert ihre Identifizierung. Die Sequenzanalyse der 16S-23S Intergenic Spacer (ITS)-Region hat sich als nützliches Mittel zur Artenidentifizierung der Gattungen Streptococcus und Enterococcus erwiesen. Diese Studie untersuchte die Möglichkeit, die ITS-Sequenzanalyse als allgemeines Mittel zur Artenidentifizierung innerhalb der Gattungen Aerococcus, Abiotrophia, Alloiococcus, Dolosicoccus, Dolosigranulum, Facklamia, Granulicatella, Gemella, Ignavigranum, Leuconostoc und Vagococcus zu verwenden. Es wurden die ITS-Sequenzen von 29 Typstämmen und 103 gut charakterisierten klinischen Stämmen bestimmt und zur Artenidentifizierung eine BLAST-Analyse durchgeführt. Alle klinischen Stämme wurden überzeugend bis auf Artenebene identifiziert. Die phylogenetische Analyse zeigte eine deutliche Häufung von Stämmen mit den zugeordneten Arten und den jeweiligen Typstämmen. Somit war die ITS-Sequenzanalyse für die Artenidentifizierung von Bakterien der Gattungen Katalase-negative und Gram-positive Kokken nützlich. Potentiell könnte ITS als erstes Identifizierungsinstrument für die Gruppe der Katalase-negativen, Gram-positiven Kokken angesehen werden, einschließlich nichthämolysierender Streptokokken, Enterokokken und der in dieser Studie untersuchten Taxone.