Pharmaceutica Analytica Acta

Abstrakt

Schwingungsstudien und DFT-Berechnungen von Cytosin, Thiocytosin und ihren Kationen und Anionen

Yadav RA, Rashmi Singh und Mayuri Srivastava

Es wurden DFT-Berechnungen durchgeführt, um die optimierten Molekülgeometrien, APT-Ladungen und Grundschwingungsfrequenzen zusammen mit ihren entsprechenden IR-Intensitäten, Raman-Aktivitäten und Depolarisationsverhältnissen der Raman-Bänder für die neutralen Cyt- und TCyt-Moleküle und ihre Kationen und Anionen zu berechnen. Dazu wurde die DFT/B3LYP-Methode mit dem Basissatz 6-311++G** unter Verwendung der Software Gaussian-03 verwendet. TCyt, Cyt+ und TCyt+ zeigen planare Strukturen und gehören zur Punktgruppensymmetrie Cs, während Cyt, Cyt- und TCyt- nicht-planare Strukturen mit Punktgruppensymmetrie C1 besitzen. Es wurde eine Konformationsanalyse durchgeführt, um die stabilsten Konfigurationen dieser Moleküle zu erhalten. Die normalen Schwingungsmodi für alle Arten wurden auf der Grundlage von PEDs zugewiesen, die unter Verwendung der Software GAR2PED aus einer Normalkoordinatenanalyse gewonnen wurden. Informationen über Größe, Form, Ladungsdichteverteilung und Ort der chemischen Reaktivität des Moleküls wurden durch die Abbildung der Elektronendichte-Isofläche mit Oberflächen des molekularen elektrostatischen Potenzials (MEP) erhalten. Der Energieabstand von HOMO zu LUMO des Cyt beträgt 5,2963 eV und der von TCyt 5,0062 eV.