Zeitschrift für mikrobielle und biochemische Technologie

Abstrakt

Entschlüsselung verborgener Stoffwechselfunktionen in mikrobiellen Mattenökosystemen durch die Kombination von In-situ -Messungen und Omic-Ansätzen

Mohammad AA Al-Najjar

Mikrobielle Matten sind einzigartige Ökosysteme, die vielfältige Stoffwechselfähigkeiten beherbergen, die von der Photosynthese in der oberen Schicht bis hin zur Gärung und dem Abbau organischer Materialien, begleitet von Methanproduktion in der tiefsten Schicht, reichen. Mikroorganismen in einer mikrobiellen Matte gedeihen erfolgreich in extremen Umgebungen, weil sie ihren Stoffwechsel als Reaktion auf Veränderungen in ihrer Umgebung umstellen können. Diese metabolische Flexibilität und Fähigkeiten der Mikroorganismen werden unterschätzt, weil sich die meisten Studien bisher auf die Messung von Verhaltensänderungen der sie bewohnenden Mikroorganismen oder auf bestimmte biochemische Indikatoren oder auf die Veränderung der Struktur der mikrobiellen Gemeinschaft konzentrierten. Um unser Verständnis der Stoffwechselfähigkeiten jedoch erweitern zu können, muss eine intensive Untersuchung der zugrundeliegenden molekularen Mechanismen durchgeführt werden. Daher ist der beste Ansatz die Kombination von In-situ-Messungen mit Omics-Analysen (d. h. Matatranskriptomik und/oder Metaproteomik) als Reaktion auf Veränderungen der Umweltbedingungen.