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Abstrakt
Das Spliceosomale Protein SnRNP F bindet sowohl an die U3- als auch an die U14-Klasse von snoRNA in Giardia lamblia
Arjun Ghosh, Sumalya Karmakar, Avik K. Mukherjee, Dibyendu Raj, Koushik Das, Srimanti Sarkar, T. Nozaki und Sandipan Ganguly
Das kleine nukleäre Ribonukleoprotein F (snRNP F) ist ein spliceosomales Protein, das sich mit kleinen nukleären RNAs (snRNA) der Klassen U1, U2, U4/U6 und U5 verbindet und spliceosomale Komplexe bildet, die für die Prä-mRNA-Verarbeitung verantwortlich sind. Diese Studie berichtet über die ungewöhnliche Interaktion von giardialem snRNP F mit kleinen nukleolären RNAs (snoRNA), die für die Prä-rRNA-Verarbeitung verantwortlich sind. Der Electrophoretic Mobility Shift Assay wurde verwendet, um die Interaktion dieses Proteins mit snoRNA der Klassen U3 und U14 des früh verzweigten Eukaryoten Giardia lamblia nachzuweisen. Aus unserer Studie ging auch hervor, dass sich snRNP F in Giardia evolutionär von seinen anderen eukaryotischen Orthologen unterscheidet.