Zeitschrift für Pharmakogenomik und Pharmakoproteomik

Abstrakt

Die Prävalenz seltener Varianten ist möglicherweise wichtig für die Reaktion der litauischen Bevölkerung auf zur Behandlung von Herz-Kreislauf-Erkrankungen eingesetzte Medikamente

Pranculis A, RanÄelis T, AmbrozaitytÄ— L, UktverytÄ— I, DomarkienÄ— I, BurokienÄ— N, KuÄ inskienÄ— ZA und KuÄ inskas V

Herz-Kreislauf-Erkrankungen (CVD) sind eine der häufigsten Todesursachen in Europa und weltweit. Wichtige Faktoren, die für die Wirksamkeit oder die unerwünschten Arzneimittelwirkungen (ADRs) von Medikamenten zur Behandlung von CVD als relevant erachtet werden, wurden durch GWAS-Studien ermittelt, bei denen meist niedrigdichte Genotypisierungs-Arrays für gemeinsame Varianten verwendet wurden. In dieser Studie wurde eine Exomsequenzierung (WES) durchgeführt, um für die Behandlung von CVD relevante Genomvarianten zu identifizieren. Die Studiengruppe umfasste 98 (49 Männer und 49 Frauen) gesunde, nicht verwandte Personen aus der litauischen Bevölkerung mit mindestens drei Generationen litauischer Ethnizität und Wohnsitz in derselben ethnolinguistischen Region. Nach der Durchführung der WES wurden die genetischen Loci von 55 Genen, die für die Wirksamkeit oder die ADRs von Medikamenten zur Behandlung von CVD als relevant erachtet wurden, mithilfe der Software LifeScopeTM und ANNOVAR analysiert. Die Analyse kleiner Indels in den ausgewählten Regionen ergab 13 exonspezifische Frameshift-Indels und eine einzige intronenspezifische Spleißstellenvariante, die die Wirksamkeit beeinträchtigen oder bei Patienten, die wegen kardiovaskulärer Erkrankungen behandelt werden, ADRs verursachen können. In den Genen, die als wichtig für die Behandlung von kardiovaskulären Erkrankungen gelten, wurden über 400 potenziell relevante SNVs in unterschiedlichen Häufigkeiten nachgewiesen. Die Analyse der Beweiskraft ergab 14 SNVs, die wahrscheinlichsten für die Behandlung von kardiovaskulären Erkrankungen relevant sind. Die Häufigkeitsverteilung mehrerer Variantenallele, die sich als äußerst wichtig für die Behandlung von kardiovaskulären Erkrankungen erwiesen haben, in den Genen CYP2D6 (rs16947) und ADRB1 (rs1801253) sowie mehrere Varianten in den Genen CYP2C9 und NAT2 unterscheiden sich signifikant (p<0,05) von anderen kaukasischen Populationen, was den potenziellen Nutzen pharmakogenomischer Tests vor der Behandlung der litauischen Bevölkerung zeigt. Die Forschung wurde im Rahmen des LITGEN-Projekts durchgeführt. Das Projekt LITGEN (VP1-3.1-ŠMM-07-K-01-013) wurde im Rahmen der Maßnahme „Global Grant“ vom Europäischen Sozialfonds gefördert.