Zeitschrift für Pflanzenpathologie und Mikrobiologie

Abstrakt

Genomischer Fingerabdruck mittels Rep-PCR enthüllte genetische Vielfalt und Populationsstruktur unter äthiopischen Isolaten von Pseudocercospora griseola, dem Erreger der Gartenbohne ( Phaseolus vulgaris L.).

Yayis Rezene, Kassahun Tesfaye, Mukankusi Clare, Allan Male und Paul Gepts

Die Blattfleckenkrankheit ( Pseudocercospora griseola ) ist eine der verheerendsten Krankheiten, die den Gartenbohnenanbau in großen Teilen Äthiopiens befällt. Die Verwendung von Gartenbohnensorten mit dauerhafter Resistenz ist daher die wirksamste und kostengünstigste Bekämpfungsmaßnahme. Kenntnisse über die genetische Variabilität und Populationsstruktur der Erregerpopulationen sind für ein erfolgreiches Programm zur Verbesserung der Gartenbohne wichtig. Das Ziel dieser Studie war, die genomische Vielfalt unter und zwischen P. griseola- Isolaten zu bestimmen, die aus einer Felduntersuchungssammlung in verschiedenen Gartenbohnen-Anbaugebieten Äthiopiens gewonnen wurden. Die Studie verwendete das Protokoll der Polymerase-Kettenreaktion mit repetitiven extragenen palindromischen Elementen zur Identifizierung der DNA-Sequenzdiversität. Zur Untersuchung der genetischen Vielfalt analysierten wir molekulare Daten von 79 Einzelsporenisolaten des P. griseola -Erregers. Die Molekulare Varianzanalyse (AMOVA) und die Clusteranalyse enthüllten somit das Vorhandensein einer hohen genetischen Vielfalt innerhalb und zwischen P. griseola- Isolaten. ERIC-PCR ergab 21 verschiedene Clustermuster, während REP-PCR und BOX-PCR 11 bzw. 5 verschiedene Clustermuster ergaben. Dies liegt daran, dass einige Isolate, die dieselben BOX-Muster aufwiesen, anhand der ERIC- und REP-Fingerabdruckmuster unterschieden werden konnten. Die kombinierten Fingerabdruckmuster von ERIC-, BOX- und REP-PCR unterschieden 25 verschiedene Muster unter den 79 monosporen P. griseola- Isolaten, die bei einer Cut-off-Matrix von 77 % genetischer Ähnlichkeit erzeugt wurden. Diese unterschiedenen Cluster enthüllten die Existenz genetischer Vielfalt innerhalb und zwischen den Isolaten von P. griseola, die aus den verschiedenen Anbaugebieten für Gartenbohnen in Äthiopien gesammelt wurden.