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Abstrakt
Bericht über die Wechselwirkung zwischen Kalbsthymus-DNA und Pyrimidin-anelliertem Spiro-Dihydrofuran
Swarup Roy, Sintu Ganai, Raj Kumar Nandi, KC Majundar und Tapan K. Das
Die Untersuchung der Bindungswechselwirkung zwischen Pyrimidin-anelliertem Spiro-Dihydrofuran (PSDF) und Kalbsthymus-DNA (CTDNA) unter Verwendung von UV-Absorption, Fluoreszenz, Zirkulardichroismus (CD) und molekularen Dockingmethoden. Die experimentellen Ergebnisse zeigten, dass PSDF bevorzugt an die Furche von CTDNA bindet, mit einer Bindungskonstante (K) von 1,51×102 L/mol bei 293 K. Basierend auf den Vorzeichen und Größenordnungen der Enthalpieänderung (ΔH = -33,25 kJ/mol) und Entropieänderung (ΔS = -71,58 J/mol/K) im Bindungsprozess kann der Schluss gezogen werden, dass die wichtigsten Wechselwirkungskräfte zwischen PSDF und CTDNA im Bindungsprozess die Van-der-Waals-Kräfte und Wasserstoffbrücken waren. Die Ergebnisse der CD-Experimente zeigten, dass PSDF die native Konformation von CTDNA nicht störte, und anhand der Ergebnisse des molekularen Dockings wurde eine signifikante Bindung von PSDF im PSDF-CTDNA-Komplex beobachtet.