Zeitschrift für Pflanzenpathologie und Mikrobiologie

Abstrakt

Beziehung zwischen Luteovirus und PAV-Gerstengelbverzwergungsvirus

Hoda MA Waziri*, Hala A Amin, KE Saker, AM Soliman

Das aus in Ägypten angebauten Weizenpflanzen isolierte Gelbverzwergungsvirus der Gerste (BYDV-PAV) wurde charakterisiert. Zwei codierende Regionen des Isolats des Gelbverzwergungsvirus der Gerste (BYDV-PAV) für das Polymerasegen (P1) im offenen Leserahmen (ORF1) und das Hüllproteingen (CP) im offenen Leserahmen (ORF3) wurden als Ziel ausgewählt. Zwei Sätze spezifischer Primer wurden auf Grundlage des BYDV-PAV-Isolats in der Genbank entwickelt. Die DNA-Fragmente von ORF1 und ORF3 eines ägyptischen Isolats von BYDV-PAV wurden geklont und sequenziert. Die Sequenz enthielt einen vollständigen ORF1, der für das virale Polymerasegen (P1) codiert. Er ist 910 Knoten lang und codiert eine vorhergesagte Polypeptidkette aus 303 Aminosäuren mit einem M(r) von 34,67. Andererseits ergaben die Sequenzdaten für den ORF3, der das virale Hüllprotein kodiert, dass er 603 bp lang ist und ein Protein mit 200 Aminosäuren und einem Molekulargewicht von 21,96 kDa kodiert. Der phylogenetische Homologiebaum auf Grundlage der multiplen Sequenzvergleiche des ägyptischen Isolats Egy-Wz mit den in der NCBI GenBank verfügbaren Isolaten ergab jedoch, dass das Polymerasegen (P1) auf Aminosäure- und Nukleotidebene 76,5 %–99 % bzw. 71,6 %–93,2 % Sequenzidentität mit den Isolaten 05GG2, PAV 014 bzw. PAV014, PAV-Aus aufweist. Andererseits zeigte das Hüllprotein-Gen (CP) eine Sequenzähnlichkeit von 85,1 % – 99,5 % und 89,7 % – 99,2 % mit zwei Isolaten, 06KM14 und 05GG2, auf Aminosäure- bzw. Nukleotidebene.