Zeitschrift für Pflanzenpathologie und Mikrobiologie

Abstrakt

Polymerase- und Hüllprotein-Gene wurden im Weizengelbverzwergungsvirus gezielt identifiziert und charakterisiert, die abgeleiteten Aminosäuren wurden mit Gruppenmitgliedern in der Genbank verglichen

Hoda Waziri*

In Ägypten angebaute Weizenpflanzen zeigen virusähnliche Symptome. Die Gelbverzwergung des Weizens wurde mithilfe der RT-PCR-Technik charakterisiert. Zwei codierende Regionen des Isolats des Weizengelbverzwergungsvirus (WYDV-PAV) für das im offenen Leserahmen (ORF1) gelegene Polymerasegen (P1) und das im offenen Leserahmen (ORF3) gelegene Hüllproteingen wurden anvisiert. Zwei
Sätze spezifischer Primer wurden basierend auf dem BYDV-PAV-Isolat in der Genbank entwickelt. Die DNA-Fragmente von ORF1 und ORF3 eines ägyptischen Isolats von BYDV-PAV wurden geklont und sequenziert. Die Sequenz enthielt einen ORF1 in voller Länge, der für das virale Polymerasegen codiert. Er ist 910 nt lang und codiert eine vorhergesagte Polypeptidkette aus 303 Aminosäuren mit einem M(r) von 34,67. Andererseits ergaben die Sequenzdaten für den ORF3, der das virale Hüllprotein kodiert, dass er 603 bp lang ist und für ein Protein mit voraussichtlich 200 Aminosäuren und einem Molekulargewicht von 21,96 kDa kodiert. Der phylogenetische Homologiebaum auf Grundlage der multiplen Sequenzvergleiche des ägyptischen Isolats Egy-Wz mit den in NCBI GenBank verfügbaren Isolaten ergab jedoch, dass das Polymerasegen auf Aminosäure- und Nukleotidebene 76,5–99 % bzw. 71,6–93,2 % Sequenzidentität mit den Isolaten 05GG2, PAV 014 bzw. PAV014, PAV-Aus aufweist. Andererseits zeigte das Hüllprotein-Gen auf Aminosäure- und Nukleotidebene eine Sequenzähnlichkeit von 85,1–99,5 % bzw. 89,7–99,2 % mit zwei Isolaten, 06KM14 und 05GG2.