Zeitschrift für mikrobielle und biochemische Technologie

Abstrakt

Die Phylogenese verschiedener Helicobacter pylori- Stämme konnte aufgrund der hohen Ähnlichkeit der Gensequenzen zwischen den Stämmen nicht durch das 16S rRNA-Gen erklärt werden

Wenfa Ng

Das Verständnis der evolutionären Verwandtschaft verschiedener Stämme einer Art hat dabei geholfen, stammspezifische Unterschiede zu identifizieren, die für die Diagnose und Behandlung von Krankheiten hilfreich sein können. Normalerweise wird eine solche Typisierung auf Stammebene durch molekulare Tests wie DNA-Sequenzierung und phylogenetische Baumanalyse ergänzt. Diese Arbeit nutzt öffentliche Daten zur 16S -rRNA-Gensequenz verschiedener Stämme von Helicobacter pylori , um den phylogenetischen Baum zu zeichnen, der die Evolutionsverläufe der verschiedenen Stämme beschreibt. Ergebnisse aus der multiplen Sequenzalignment-Analyse zeigen ein hohes Maß an Konservierung der 16S -rRNA-Gensequenz über Stämme hinweg. Dies lässt sich dann in eine phylogenetische Baumstruktur umsetzen, die auf sehr enge evolutionäre Verwandtschaftsverhältnisse der verschiedenen Stämme mit Ausnahme eines Ausreißerstamms schließen lässt. Selbst im Fall des Ausreißerstamms war sein evolutionärer Abstand zu anderen Artgenossen nicht groß. Insgesamt deuten die Ergebnisse dieser Studie darauf hin, dass das 16S rRNA-Gen möglicherweise nicht die Phylogenese auf Stammebene zwischen verschiedenen Stämmen derselben Art erfasst, und weisen auf Bemühungen hin, diesen phylogenetischen Effekt in anderen Genen der Art aufzuklären. Solche Gene könnten bei der Pathogenese beim Menschen an der Virulenz beteiligt sein und daher einem höheren Evolutionsdruck und einer höheren natürlichen Selektion ausgesetzt sein.