Zeitschrift für Bakteriologie und Parasitologie

Abstrakt

Phylogenetische Gruppierung dominanter fäkaler Escherichia coli-Isolate von gesunden Männern und Frauen in Al-Kut/Provinz Wasit/Irak

Sareaa MG Al-Mayahie, Alaa AM Al-Khafajy, Nuha AS Dosh, Assel RK Al-Rekabi und Ahlam GN Al-Atabie

Fäkalisolate von Escherichia coli werden in vier phylogenetische Hauptgruppen unterteilt, die als A, B1, B2 und D bezeichnet werden. Die meisten Kommensal-Stämme gehören zur Gruppe A und haben weniger Virulenzfaktoren als die extraintestinalen pathogenen E. coli-Stämme (ExPEC). Diese Studie wurde hauptsächlich für die phylogenetische Gruppierung von kommensalen fäkalen E. coli-Isolaten von gesunden Männern und Frauen in der Stadt Al-Kut/Provinz Wasit/Irak unter Verwendung PCR-basierter Protokolle konzipiert. Unter diesen Isolaten wurden auch die Virulenzgene von ExPEC nachgewiesen. Unter den in dieser Studie untersuchten Isolaten (n = 205) war Gruppe A bei weiblichen und männlichen Isolaten am häufigsten (68,5 % gegenüber 63,0 %), gefolgt von den Gruppen B1 (15,7 % gegenüber 22,6 %), D (10,7 % gegenüber 9,5 %) und B2 (4,1 % gegenüber 4,7 %). Die Geschlechtsverteilung der phylogenetischen Gruppen zeigte unbedeutende Unterschiede zwischen weiblichen und männlichen Isolaten. Die weiblichen und männlichen Isolate unterschieden sich bei allen nachgewiesenen Virulenzgenen von ExPEC nicht signifikant, mit Ausnahme von papC, das bei männlichen Isolaten (16,6 %) signifikant häufiger vorkam (P ≤ 0,05) als bei weiblichen Isolaten (6,6 %). In den Isolaten sowohl der Weibchen als auch der Männchen waren die am häufigsten vorkommenden Virulenzgene fimH (97,5 % vs. 100 %) und iucC (52,0 % vs. 55,9 %), während sfa/foc (jeweils 0 %) und hly (0,82 % vs. 0 %) am wenigsten verbreitet waren. Darüber hinaus konzentrierten sich Virulenzgene in Isolaten der Gruppe B2.
Sowohl bei Weibchen als auch bei Männchen war ein hoher Prozentsatz dominanter kommensaler fäkaler E. coli-Isolate von Irakern in Al-Kut City in der Phylogruppe A zusammengefasst, gefolgt von den Gruppen B1 und D, während Gruppe B2 selten war. Außerdem waren dominante fäkale Stämme mit ExPEC-Eigenschaften viel seltener.