Gentechnologie

Abstrakt

Phänotypische und genotypische Charakterisierung von Carnobacterium divergens, isoliert aus gekühltem tunesischem gehacktem rohem Rinderfleisch

Thouraya Mokrani, Ines Essid, Mnasser Hassouna, Lachheb Jihene, Ghram Abdeljalil und Ahlem Jouini

Sechs psychotrope Stämme von Carnobacterium divergens wurden aus gehacktem rohem tunesischen Rindfleisch isoliert, das verpackt und bei 6 °C gelagert wurde. Sie wurden zunächst mit biochemischen Methoden identifiziert. Vor ihrer Charakterisierung mit molekularen Techniken wurden biochemische Reaktionen und Kohlenhydratfermentation eingesetzt. Der Stamm von Carnobacterium divergens ist ein unbewegliches, grampositives psychotropes Stäbchen ohne Katalase, Oxidase und Mannitol. Es wächst bei einem pH-Wert von 9,1 (D-MRS-Agar), jedoch nicht auf Acetat-Agar (pH-Wert ≤ 5,4). Bei all diesen Isolaten ergab die phänotypische Identifizierung mit dem API 50 CHL-System eine Variabilität in der Fermentationsfähigkeit einiger Zucker (Glycerin, Amygdalin, Arbutin, D-Trehalose und Kaliumgluconat). Zur Identifizierung dieser isolierten Stämme auf Artenebene wurden speziesspezifische Primer für die Polymerase-Kettenreaktion (PCR) verwendet. Darüber hinaus bestätigte die Sequenzierung des 16S-rRNA-Gens, dass alle sechs Isolate als C. divergens identifiziert wurden. Die Rep-PCR-Technik wurde durchgeführt, um die intraspezifische Diversität innerhalb dieser sechs Stämme von C. divergens zu untersuchen, die häufig in Fleisch nachgewiesen werden. Die Rep-PCR-Methode unterschied die C. divergens-Stämme und demonstrierte ihre Artenvielfalt und ihre offensichtlichen Ähnlichkeiten. BOX- und REP-Primer ermöglichten eine Amplifikation mit 85 % bzw. 80 % Ähnlichkeit zwischen den Stämmen. Die BOXA1R- und REP-Primer erwiesen sich als nützlich für die Differenzierung von C. divergens-Stämmen.