Zeitschrift für Bioäquivalenz und Bioverfügbarkeit

Abstrakt

Leitstrukturoptimierung auf Basis von Pharmakophoren und molekulare Dockinganalyse zur Erkennung wirksamer Inhibitoren des HCRTR2-Proteins

Mariam Maqbool*

Schlaflosigkeit ist ein wachsendes Problem der öffentlichen Gesundheit, da ihre Verbreitung von Tag zu Tag zunimmt. Sie ist eine der häufigsten Schlafstörungen unter Asiaten. Jeder zehnte Mensch, der an Schlaflosigkeit leidet, hat Schlaflosigkeit. Von allen Schlafstörungen erfüllen etwa 6 bis 10 % die Kriterien für Schlaflosigkeit. Frauen kommen im Vergleich zu Männern häufiger vor. In dieser Forschungsarbeit konzentrieren wir uns auf die Identifizierung potenzieller zielgerichteter Medikamente, um eine wirksame Behandlung mit Heilpflanzen zu ermöglichen. In dieser Forschungsstudie wurde ein ligandenbasierter Pharmakophor-Ansatz verwendet, gefolgt von molekularem Docking und virtuellem Screening. Der Protox-Server wurde zur Vorhersage der Toxizitätsklasse verwendet. Die molekularen Eigenschaften chemischer Bestandteile mit schlaffördernden Eigenschaften wurden mit Swiss ADME, dem ADMET-Eigenschaftsvorhersagetool und dem Osiris-Eigenschaftsexplorer-Tool überprüft. Es wurde ein ligandenbasiertes Pharmakophor von vier Verbindungen von Osmium basilicum durchgeführt und anschließend mithilfe eines Ligandenscouts gegen die Zink-, Princeton- und Arzneimittelbankbibliotheken gescreent. Anschließend wurde die Verbindung mit dem höheren Pharmakophor-Fit-Score mit CID NS_013367, NS_005529, NS_007342, NS_011378 und NS_011361 ausgewählt. NS_011285 wurde zum Docking ausgewählt. Das molekulare Docking des gewünschten Zielproteins HCRTR2 wurde mit den gescreenten Verbindungen nacheinander unter Verwendung von Autodockvena durchgeführt und dann wurde die beste Pose mit dem besten Lage- und Orientierungswinkel für weitere Studien ausgewählt, die die geringste Bindungsenergie aufweisen, und die Dockingergebnisse wurden mit Pymol und Discovery Studio analysiert. Die Verbindung mit der CID-Nummer NS_011285 besitzt die beste Pose und mehr oder weniger Bindungsenergie –9,4 im Vergleich zu anderen Verbindungen. Die 2D-Struktur zeigt die Interaktion der 2D-Aminosäuren MET, VAL, LEU, PHE und ARG mit dem mutierten Protein HCRTR2 und Interaktionsarten wie Alkyl, Pi-Alkyl, Pi-Sigma und Pi-Schwefel. Schließlich haben wir ein Liganden identifiziert, das die besten arzneimittelähnlichen Eigenschaften und das Potenzial zur Hemmung der HCRTR2-Aktivität besitzt, die der Hauptverursacher von Schlaflosigkeit ist.