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Abstrakt

Pathogene und genetische Charakterisierung von Xanthomonas campestris Pv. campestris-Rassen basierend auf Rep-PCR und Multilocus-Sequenzanalyse

Priyanka Singh Rathaur, Dinesh Singh, Richa Raghuwanshi und Yadava DK

Xanthomonas campestris pv. campestris (Pammel) Dowson (Xcc) ist der Erreger der Schwarzfäule bei Kreuzblütlern weltweit. 75 Isolate von Xcc wurden in 12 agroklimatischen Regionen Indiens gesammelt, um das Verbreitungsmuster der Rassen und die Diversität der Population zu bestimmen. Basierend auf der pathogenen Reaktion auf sieben standardmäßige Kreuzblütlerarten wurde festgestellt, dass Rasse 1, 4 und 6 vorherrschend sind. Zur Beurteilung der pathogenen Diversität wurden 41 Sorten von Kreuzblütlern, darunter sieben Brassica- und Coeno-Arten, unter Feldbedingungen künstlich inokuliert. Brassica juncea-Sorten (Pusa Bold, Varuna, Pusa Vijay, Pusa Mustard 21 und Pusa Mustard 25) zeigten Resistenz gegen alle Stämme von Xcc, während sich die Brassica olerecea-Sorte Pusa Ageti als resistent gegen die Rassen 1 und 4 erwies. Die genetische Charakterisierung dieser 75 Xcc-Stämme erfolgte mittels rep-PCR (ERIC, REP und BOXPCRs), gefolgt von einer phylogenetischen Analyse. Die Xcc-Stämme wurden in 6 Gruppen mit einem Ähnlichkeitskoeffizienten von 50 % zusammengefasst und aus diesen Gruppen wurden 28 Xcc-Stämme der Rassen 1, 4 und 6 unter Gruppe 5 zusammengefasst. Sequenzen der 16S rRNA-, hrpF- und efP-Gene von fünf Stämmen, die die Rassen 1, 4 und 6 repräsentieren, wurden für die Multilocus-Sequenzanalyse verwendet. Auf der Grundlage einer Sequenzanalyse der 16S rRNA- und hrpF-Gene stellte sich heraus, dass die indischen Stämme sehr eng mit dem Stamm Xcc ATCC 33913 (Rasse 3, Großbritannien) verwandt sind. Auf der Grundlage der efP-Sequenzen stellte sich heraus, dass sie eng mit den Stämmen Rasse 1 Xcc B100 (Italien) und Rasse 9 Xcc 8004 (Großbritannien) verwandt sind.

Haftungsausschluss: Dieser Abstract wurde mit Hilfe von Künstlicher Intelligenz übersetzt und wurde noch nicht überprüft oder verifiziert.