Zeitschrift für mikrobielle und biochemische Technologie

Abstrakt

Optimierung der Extraktionsmethode für GC-MS-basierte Metabolomik für filamentöse Pilze

Siribhorn Madla, Daisuke Miura und Hiroyuki Wariishi

Die Extraktion von Metaboliten gilt als einer der wichtigsten Schritte zur Qualitätskontrolle in der metabolomischen Forschung. In der vorliegenden Studie wurde das optimale Extraktionsprotokoll für intrazelluläre Metaboliten von Pilzen untersucht. Zwei Extraktionsprotokolle mit verschiedenen Lösungsmittelsystemen, Methanolextraktion und zweiphasige Extraktion unter unterschiedlichen pH-Bedingungen, wurden verglichen. Als Kriterien wurden die Anzahl der erkannten Peaks, Variationen von Probe zu Probe und der Durchsatz des gesamten Prozesses berücksichtigt. Die extrahierten Metaboliten wurden mittels Gaschromatographie-Massenspektrometrie (GC-MS) und Hauptkomponentenanalyse (PCA) analysiert. Das Extraktionsprotokoll mit Methanol als Extraktionslösungsmittel lieferte die höchste Anzahl erkannter Peaks (~ 300 Peaks) bei gleicher Einfachheit und Geschwindigkeit, was darauf hindeutet, dass sich die Methanolextraktionsmethode für die Extraktion intrazellulärer Metaboliten aus P. chrysosporium eignet. Abhängig von der Art der betreffenden Metaboliten ist jedoch die zweiphasige Extraktionsmethode unter unterschiedlichen pH-Bedingungen für eine gezielte Analyse geeignet.