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Abstrakt
Vorkommen von Agrobacterium Vitis mit zwei Opin-Typ-Plasmiden in tunesischen Weinbergen
Samir Chebil, Rabeb Fersi, Synda Chenenaoui, Emna Abdellatif, Giuseppe Durante, Elena Zacchi, Ali Rhouma und Ahmed Mliki
Fünfzig DNA-Proben wurden aus infiziertem Holzgewebe von ein- und zweijährigen Weinrebensorten (Vitis vinifera L.) gewonnen, die in mehreren Weinbergen in der Mitte Tunesiens gesammelt wurden. Die Stämme wurden mittels eines Multiplex-PCR-Tests mit einer Kombination aus genspezifischen Primern für pehA, virF und virD2 differenziert, der die entsprechenden Fragmente aus nahezu allen Stämmen amplifizierte und klar zwischen Agrobacterium vitis- und A. tumefaciens-Stämmen mit Octopin- oder Nopalin-pTis und A. vitis-Vitopin-Stämmen unterschied. Die Isolate wurden in drei Hauptgruppen aufgeteilt: die erste Gruppe trägt Ti-Plasmide vom Octopin-Typ, die zweite Ti-Plasmide vom Vitopin-Typ und die dritte Gruppe sowohl Ti-Plasmide vom Octopin- als auch vom Vitopin-Typ. Die Polygalacturonase-Gensequenz von 10 Isolaten zeigte eine Identität von 94 – 97 % mit den zuvor in der NCBI-GenBank-Datenbank hinterlegten Sequenzen von A. vitis. Die erhaltenen Nukleotidsequenzen wurden der Genbank unter den Zugangsnummern JX946285 bis JX946294 vorgelegt.