Zeitschrift für Karzinogenese und Mutagenese

Abstrakt

Gene der Mucin-Familie sind bei Patienten mit Dickdarmkrebs herunterreguliert

Mohammad Azhar Aziz, Majed AlOtaibi, Abdulkareem AlAbdulrahman, Mohammed AlDrees und Ibrahim AlAbdulkarim

Es ist allgemein bekannt, dass Mucine mit verschiedenen Krebsarten in Zusammenhang stehen. Ihre Rolle bei Darmkrebs wurde umfassend untersucht, ohne dass eine direkte Korrelation mit ihren Änderungen der Expressionsniveaus besteht. In der vorliegenden Studie verwendeten wir das menschliche Exon-Array von Affymetrix, um nachzuweisen, dass Mucin-Familiengene in Darmkrebs-Tumorproben herunterreguliert sind. Wir analysierten 92 Proben aus normalem und Tumorgewebe. Alle Mucin-Familiengene außer MUCL1 waren herunterreguliert, wobei der mit der Software AltAnalyze berechnete Wert der Änderung zwischen -3,53 und 1,78 lag. Der maximale Abfall der RNA-Transkripte wurde für MUC2 mit einer Änderung von -3,53 beobachtet. Darüber hinaus führten wir eine Integromics-Analyse durch, um Mucin-Gene mithilfe hierarchischer Clusterung zu analysieren. MUC1 und MUC4 erwiesen sich als potenzielle Biomarker für menschlichen Darmkrebs. Für Mucin-Gene wurden die wichtigsten Upstream-Regulatoren identifiziert. Netzwerkanalysen wurden durchgeführt, um unser Verständnis über potenzielle Mechanismen zu vertiefen, durch die Mucine an der Entstehung von Darmkrebs beteiligt sein können.