Biochemie und analytische Biochemie

Abstrakt

Mitochondriale Genomanalyse und Auswertung der Phylogenese und Divergenzzeit der Strix aluco

David Smith1, Renna Roy2*

In dieser Studie wurde zum ersten Mal ein vollständiges mitochondriales Genom von Strix aluco mit einer Gesamtlänge von 18.632 bp gemeldet. Es gab 37 Gene, darunter 22 tRNAs, 2 rRNAs, 13 proteinkodierende Gene (PCGs) und 2 nichtkodierende Kontrollregionen (D-Loop). Die Sequenzierung der zweiten Generation des vollständigen mitochondrialen Genoms von S. aluco wurde mithilfe der Illumina-Plattform durchgeführt, dann wurde Tytoninae als Außengruppe verwendet, die Software PhyloSuite wurde angewendet, um den ML-Baum und den BI-Baum der Strigiformes zu erstellen , und schließlich wurde der Divergenz-Zeitbaum mithilfe der Software Beast 2.6.7 konstruiert und das Alter der fossilienhaltigen Sedimente von Miosurniadiurna (6,0–9,5 mA) wurde als interner Korrekturpunkt festgelegt. Es wurde bestätigt, dass der gemeinsame Vorfahr der Strix während des Pleistozäns divergierte (2,58~0,01 mA). Die dramatische Hebung des Qinling-Gebirges im Mittelpleistozän und die Klimaschwankungen des Pleistozäns führten gemeinsam zur Divergenz der Strix zwischen den nördlichen und südlichen Teilen des chinesischen Festlands. Die Isolation der glazial-interglazialen Rotation und der Gletscherrückzugsgebiete war der Hauptgrund für die Divergenz des gemeinsamen Vorfahren der Strix uralensis und der S. aluco während dieser Zeit. Diese Studie liefert eine Referenz für die Evolutionsgeschichte der Strix .