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Abstrakt
Statistische Analyse von GEO-Datensätzen im großen Maßstab
Bernard Ycart, Konstantina Charmpi, Sophie Rousseaux und Jean-Jacques Fournié
Das hier behandelte Problem ist die gleichzeitige Behandlung mehrerer Genexpressionsdatensätze, die möglicherweise unter unterschiedlichen experimentellen Bedingungen und/oder Plattformen gesammelt wurden. Unter Verwendung robuster Statistiken wurde eine groß angelegte statistische Analyse von 20 Datensätzen durchgeführt, die aus dem Gene Expression Omnibus-Repository heruntergeladen wurden. Die Unterschiede zwischen den Datensätzen werden mit der Variabilität innerhalb eines bestimmten Datensatzes verglichen. Es wird der Nachweis erbracht, dass durch die Zusammenführung verschiedener Quellen aussagekräftige biologische Informationen extrahiert werden können.