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Abstrakt
Identifizierung klinischer Corynebacterium striatum-Stämme durch PCR-Restriktionsanalyse unter Verwendung des Gens der RNA-Polymerase β-Untereinheit (rpob)
Sana Alibi, Asma Ferjani, Manel Marzouk und Jalel Boukadida
Corynebacterium striatum kommt in Routineuntersuchungen der klinischen Mikrobiologie häufig vor. Es ist in der Umwelt weit verbreitet und Teil der normalen Mikrobiota der Haut und Schleimhäute. Die Identifizierung dieser Art mit biochemischen Methoden ist weiterhin schwierig, und es wurden bereits mehrere Fehlidentifizierungen gemeldet. Eine Methode zur Identifizierung dieses Mikroorganismus mittels Polymerase-Kettenreaktion-Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus (PCR-RFLP) wurde auf Grundlage der hypervariablen Region des Gens der β-Untereinheit der polymorphen RNA-Polymerase (rpoB) entwickelt. Alle verfügbaren Corynebacterium-rpoB-Sequenzen wurden mittels computergestützter Restriktionsanalyse analysiert. Das mithilfe der Endonukleasen MseI und NlaIV vorhergesagte rpoB-PCR-RFLP-Muster unterschied C. striatum deutlich von allen anderen Corynebacterium-Arten. Diese Methode wurde erfolgreich zur zuverlässigen Identifizierung von 67 klinischen C. striatum-Isolaten eingesetzt und kann zur rechtzeitigen Erkennung infizierter Patienten oder für epidemiologische Studien verwendet werden.