Zeitschrift für mikrobielle und biochemische Technologie

Abstrakt

Identifizierung und Charakterisierung der Gene gtf, norB und trx in Flavobacterium Columnare

Yinfeng Zhang und Covadonga R. Arias

Drei Gene aus einer Shotgun-Genombibliothek des virulenten Flavobacterium columnare-Stammes ALG-00-530 wurden identifiziert, charakterisiert und für eine differentielle Expressionsanalyse ausgewählt, basierend auf Sequenzähnlichkeiten mit mutmaßlichen Virulenzgenen aus verwandten Arten. Diese Gene waren: Glycosyltransferase (gtf), Stickoxidreduktase (norB) und Thioredoxin (trx). Eine Sammlung von 30 F. columnare-Stämmen, darunter Stämme der Genomovars I und II, wurde auf das Vorhandensein dieser Gene getestet. Die Verteilungsmuster von gtf, norB und trx innerhalb der Arten waren nicht einheitlich. Es wurden Nukleotidsequenzvariationen zwischen den Genomovars für jedes Gen beobachtet; Stämme innerhalb desselben Genomovars hatten jedoch identische Gensequenzen. Neun Stämme von F. columnare aus beiden Genomovars wurden für eine Genexpressionsanalyse ausgewählt. Das Expressionsprofil dieser Gene variierte, wenn ausgewählte Stämme in vitro unter identischen Bedingungen gezüchtet wurden. ALG-00-530, ein hochvirulenter Stamm, wurde für den Vergleich der Genexpression unter Standardwachstumsbedingungen, eisenarmen Bedingungen und in Gegenwart von Hautexplantaten von Getüpfelten Gabelwelsen ausgewählt. Die NorB- und trx-Genexpressionsniveaus variierten, wenn ALG-00-530 unter verschiedenen Bedingungen inkubiert wurde.