Biologie und Medizin

Abstrakt

GLAD-PCR-Test von DNA-Methylierungsmarkern im Zusammenhang mit Darmkrebs

Alexey A Evdokimov, Nina A Netesova, Natalia A Smetannikova, Murat A Abdurashitov, Alexandr G Akishev, Boris S Malyshev, Evgeniya S Davidovich, Vladimir V Fedotov, Vitaliy V Kuznetsov, Yuriy D Ermolaev, Andrey B Karpov, Alexey E Sazonov, Ravil M Tahauov und Sergey Kh Degtyarev

Eine Hypermethylierung der Genregulationsregionen ist bei vielen Krebserkrankungen dokumentiert. Eine solche aberrante DNA-Methylierung in Krebszellen wird durch die DNA-Methyltransferasen Dnmt3a und Dnmt3b katalysiert, die vorwiegend RCGY-Sequenzen erkennen und methylieren, wobei R(5mC)GY-Stellen gebildet werden. Vor kurzem haben wir auf der Grundlage einer neuen methylgesteuerten DNA-Endonuklease GlaI einen GLAD-PCR-Test entwickelt, der die Bestimmung der R(5mC)GY-Stelle an einer bestimmten Position der genomischen DNA ermöglicht. In dieser Arbeit haben wir den GLAD-PCR-Test zur Identifizierung der methylierten RCGY-Stellen in den Regulationsregionen einiger herunterregulierter Gene angewendet, die mit Dickdarmkrebs (CRC) in Zusammenhang stehen. Diese Liste umfasst die Gene ADHFE1, ALX4, CNRIP1, EID3, ELMO1, ESR1, FBN1, HLTF, LAMA1, NEUROG1, NGFR, RARB, RXRG, RYR2, SDC2, SEPT9, SFRP2, SOCS3, SOX17, THBD, TMEFF2, UCHL1 und VIM. Die GLAD-PCR-Analyse ausgewählter RCGY-Stellen innerhalb der regulatorischen Regionen einiger dieser Gene zeigt ein gutes Prognosepotenzial mit relativ hoher Sensitivität und Spezifität der CRC-Erkennung in Tumor-DNA.