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Abstrakt
Genetische Variation bei den aus Zitrusfrüchten unter Lagerbedingungen isolierten Penicillia
Ahmad Ali Shahid, Mehra Azam, Muhammad Ali, Kiran Nawaz und Moazzam Anees
Pakistan ist mit 2,1 Millionen Tonnen der sechstgrößte Produzent von Kinow (Mandarinen) und Orangen weltweit. Im Rahmen dieser Untersuchung wurden Obst- und Gemüsemärkte in Lahore besucht und vierzig infizierte Zitrusproben gesammelt, oberflächensterilisiert und zur Isolierung auf Kartoffel-Dextrose-Agarmedium geimpft. Anhand von Mikroskopie und Koloniemerkmalen wurden fünf Arten der Gattung Penicillium (P. digitatum, P. expansum, P. biourgeianum) identifiziert. Genomische DNA wurde isoliert und der interne transkribierte Spacer (ITS) wurde mithilfe der Primer ITS 1 und ITS4 und der 5,8S-rRNA-Gene von Pilzen amplifiziert. Gereinigte und amplifizierte PCR-Produkte wurden später sequenziert und die sequenzierte Homologie wurde mit BLAST und einem Abgleich mit Datenbanken von Genebank oder NCBI-Software untersucht. Die DNA-Sequenzhomologie zeigte, dass die Isolate eine Homologie von über 98 % mit den bekannten DNA-Sequenzen von P. expansum, P. digitatum und P. biourgeianum in der Gendatenbank aufweisen. Unter diesen Pilzisolaten war P. biourgieanum eine weitere neu gemeldete Art, die aus infizierten Zitrusfrüchten isoliert wurde und die NCBI-Genbank-Zugangsnummer KT336317 erhielt.