Agrartechnologie

Abstrakt

Bewertung der genetischen Vielfalt in der Yamswurzel ( Dioscorea bulbifera L) mithilfe von Simple Sequence Repeats (SSR)-Markern

Aniefiok Ndubuisi Osuagwu, Edem UL

Dioscorea bulbifera ist eine wenig genutzte Kulturpflanze aus der Familie Dioscoreacea, die in den Tropen und südlich der Sahara in Westafrika weit verbreitet ist. 25 D. bulbifera- Stämme aus Westafrika aus der Keimzellenbank des International Institute of Tropical Agriculture (IITA) wurden anhand von zehn Mikrosatelliten-Loci in einem Reaktionsvolumen von 25 µl in einer 96-Well-Mikrotiterplatte-PCR-Reaktion auf genetische Diversität untersucht. Das Reaktionsgemisch bestand aus 3 µl 10 ng/ µl Matrizen-DNA, 2 µl 2,5 mM DNTPs, 1 µl 2,5 mM MgCl ₂ , je 1 µl Vorwärts- und Rückwärtsprimer, 1 µl DMSO ₄ , 0,1 µl 5 µg / µl Taq-DNA-Polymerase (Invitrogen) und 3 µl 10 ng/ µl DNA. Das Gesamtreaktionsvolumen wurde mit 13,4 µl nukleasefreiem Wasser auf 25 Volumen aufgefüllt . Das PCR-Programm bestand aus einer Denaturierung bei 94°C für 30 Sekunden, gefolgt von 35 Zyklen mit 94°C für 30 s, 55 oder 45°C für 20 s und 72°C für 30 s, mit einem abschließenden Verlängerungsschritt bei 72°C für 7 Minuten. Insgesamt wurden 74 Allele mit einer durchschnittlichen Allelzahl von 7,4 pro Locus nachgewiesen. Ein Mittelwert des polymorphen Informationsgehalts (PIC) von 0,74 zeigte das Vorhandensein von Variabilität zwischen den Akzessionen. Außerdem wurde ein mittlerer Gendiversitätswert von 0,77 beobachtet. Der SSR-Ansatz erwies sich als wertvolles Instrument zur Bestimmung der genetischen Vielfalt und der Beziehungen zwischen D. bulbifera -Akzessionen. Diese Ergebnisse sind für das Programm zur Erhaltung und genetischen Verbesserung dieser Kulturpflanze von Bedeutung.