Zeitschrift für Bluterkrankungen und Transfusionen

Abstrakt

Docking-Molekularanalyse des potenziellen Medikaments Paritaprevir gegen Mycobacterium tuberculosis (Mtb)

Ivan Vito Ferrari*, Paolo Patrizio

Mycobacterium tuberculosis (Mtb) ist der Erreger der Tuberkulose, an der jährlich 1,8 Millionen Menschen sterben. Diese Infektionskrankheit befällt im Allgemeinen die Lunge, kann aber auch andere Körperteile befallen. Die Mtb-RNA-Polymerase (RNAP) ist das Ziel des Tuberkulosemedikaments der ersten Wahl, Rifampin (Rif). Wir berichten erstmals über ein potenzielles Medikament Paritaprevir gegen eine schwere Infektionskrankheit, und zwar mit einem In-silico -Ansatz unter Verwendung von Auto Dock Vina und Auto Dock 4 (oder MGL Tool), geschätzt mit Pyrx und AM Dock Software, wobei drei verschiedene wichtige Parameter berechnet wurden: Bindungsaffinität (kcal/mol), geschätzte Ki (in nM-Einheiten) und Ligandeneffizienz (LE in kcal/mol). Nach einer selektiven Analyse von über 1.000 Medikamenten, die mit Pyrx (einer virtuellen Screening-Software für computergestützte Arzneimittelforschung) in der Ligandenbindungsstelle des Proteins (ID PDB 5UHB Kette C, DNA-gesteuerte RNA-Polymerase-Untereinheit Beta) verarbeitet wurden, stellten wir hohe Werte der 3 oben genannten Parameter von Paritaprevir fest und schlussfolgerten, dass es ein hervorragender Medikamentenkandidat für diese Art von Infektion sein könnte. Tatsächlich geht aus den Ergebnissen von Auto dock Vina und Auto dock 4 (oder Auto dock 4.2), implementiert mit dem lamarckschen genetischen Algorithmus LGA über AM Dock Software, hervor, dass dieses orale Medikament, das 2014 von der FDA zugelassen wurde, sowohl von Auto dock Vina als auch von Auto dock Vina 4 einen hervorragenden Bindungsaffinitätswert von ca. -10,00 kcal/mol, einen Ki-Wert von 40 nM und eine Ligandeneffizienz von ca. -0,15 kcal/mol hat. Diese Ergebnisse sind vergleichbar mit dem im oben genannten Protein kristallisierten Medikament, das derzeit gegen TBC eingesetzt wird.