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Abstrakt
Differential-Display-Analyse von cDNA, die an der Reaktion mikrobieller Matten nach Schwerölkontamination beteiligt ist
Sylvain Bordenave, Marisol Goni-Urriza, Pierre Caumette und Robert Duran
Unberührte mikrobielle Matten aus den Salinen der Camargue (Frankreich), die in einem Mikrokosmos gehalten wurden, wurden mit Erika-Heizöl kontaminiert, um Gensequenzen zu identifizieren, die als Reaktion auf die Kontamination mit Schweröl induziert wurden. Der Differential-Display-Ansatz wurde angepasst, um differenziell exprimierte mRNA in komplexen Bakteriengemeinschaften zu erkennen. Unter den sechs isolierten differenziell exprimierten (DD) cDNA-Fragmenten wurde eines identifiziert und mit einer ABC-artigen Effluxpumpe assoziiert. Ein zweites DD-Fragment war mit einem konservierten hypothetischen Protein verwandt, das in vielen verschiedenen Bakterienarten vorkommt. Obwohl differenziell exprimierte Fragmente nicht eindeutig identifiziert werden konnten, eröffnet diese Studie neue Perspektiven für die Verbesserung unseres Wissens über die Reaktion der mikrobiellen Gemeinschaft nach Erdölkontamination.