Zeitschrift für Pflanzenpathologie und Mikrobiologie

Abstrakt

Entwicklung einer Echtzeit-RT-PCR-Methode zur schnellen Erkennung und Quantifizierung des Southern Rice Black-streaked Dwarf Virus in Reis

Songbai Zhang, Deyong Zhang, Yong Liu, Xiangwen Luo, Jue Cheng und Jing Peng

Das Southern Rice Black-Streaked Dwarf Virus (SRBSDV) ist eine neue Erregerart der Gattung Fijivirus, Gruppe 2, die in den letzten vier Jahren (2008 – 2011) bei vielen wichtigen nach China und Südostasien importierten Getreidearten wie Reis und Mais erhebliche Ertragsverluste verursacht hat. Bemerkenswerterweise zeigt früh infizierter Reis keine typischen Symptome, wodurch erhebliche Ertragsverluste vermieden werden können. Deshalb ist es sehr wichtig, das Frühstadium einer SRBSDV-Infektion in Reis zu erkennen. Zu diesem Zweck wurde eine Echtzeit-RT-PCR-Methode entwickelt und zum Nachweis dieses Virus in Reisproben verwendet. Außerdem wurde sie mit der herkömmlichen RT-PCR verglichen. Die Ergebnisse zeigten, dass die Echtzeit-RT-PCR eine hohe Spezifität und Sensitivität für den SRBSDV-Nachweis besaß und die Beziehung zwischen den Ct-Werten und der Kopienzahl von SRBSDV linear in einem Bereich von 4,04 × 102 – ^4,04 × 107 ^Kopien /Reaktion war und die Sensitivität 150 Kopien/Reaktion erreichte. Die Intra- und Interassay-Variabilität war gering. Die Echtzeit-RT-PCR erkannte SRBSDV in 87,5 % bis 100 % der Feldreisproben, verglichen mit 63,6 % bis 100 % bei der herkömmlichen RT-PCR. Insgesamt ist die Echtzeit-RT-PCR eine wertvolle alternative Methode zum Nachweis von SRBSDV in Reis.