Sima Azadmanesh, Alireza Marefat und Kayhan Azadmanesh
Verschiedene Bakterien der Gattung Enterobacteriaceae sind als Erreger von Schwarzbeinigkeit und Weichfäule bei Kartoffeln bekannt. In dieser Studie wurde eine schnelle und spezifische Nachweismethode angewendet, um Bakterien in einigen nordwestlichen Provinzen des Iran (Zanjan, Kordestan und Ost-Aserbaidschan) zu untersuchen. Für die Studie wurden 26 Stämme ausgewählt, die in vorhergehenden Studien als repräsentative Krankheitserreger identifiziert worden waren, und zwar: 14 Pectobactrium carotovorum subsp carotovorum, 7 Dickeya chrysanthemi und 5 Pectobactrium atrosepticum. Die Primer Y1/Y2, Expccf/r, ADE1/2 und Eca1f/r wurden als spezifische Primer für die Krankheitserreger veröffentlicht. Sie wurden getestet, um festzustellen, ob sie für die spezifische Amplifikation von DNA in den Stämmen verwendet werden könnten. Das erwartete spezifische Fragment wurde in vielen Stämmen nicht amplifiziert, oder es wurden mehrere unspezifische Bänder amplifiziert, einige davon nahe an den erwarteten Fragmenten. Durch Sequenzierung der ITS-Region repräsentativer Stämme wurden spezifische Primer zur Amplifikation der DNA von Krankheitserregern entwickelt und ein PCR-Test
entwickelt. Im PCR-Test wurde ein 300-bp-Fragment aus allen in den Provinzen gesammelten Stämmen amplifiziert. In Spezifitätstests wurden keine PCR-Produkte von anderen Bakterien anderer Gattungen erhalten.