Kwasi Adusei-Fosu und Matthew Dickinson
Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE), ein Erreger der Fusarium-Welke bei Ölpalmen, kann mittels Polymerase-Kettenreaktion (PCR) nachgewiesen werden, ist aber sehr zeitaufwändig. Mittels Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) wurde Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE) in Ölpalmensämlingen rasch nachgewiesen. Um den Forschungsumfang zu erweitern, wurden acht weitere Fusarium oxysporum-Isolate aus symptomatischen Ölpalmen (d. h. mutmaßliche FOE, da ihre Pathogenität nicht bestätigt wurde) und fünf weitere Nicht-FOE-Isolate aus symptomatischen ausgewachsenen Ölpalmen bzw. Tomaten entnommen. Die Identitäten von FOE, mutmaßlichen FOE und Nicht-FOE wurden durch Sequenzierung festgestellt. LAMP-Primer zum Nachweis von FOE oder mutmaßlichen FOE basierten auf Partialsequenzen von Secreted in Xylem (SIX8) und P-450-Cytochrom. Die früheste Nachweiszeit für SIX8- und P-450-Cytochrom-Primer betrug 4:00 Min. bzw. 6:45 Min., wobei beide die späte Nachweiszeit von 26:30 Min. aufzeichneten. Zur Beurteilung des Spezifitätsgrads für SIX8- und P-450-Cytochrom wurden Annealing-Ableitungskurven verwendet, aber keiner der LAMP-Primer konnte zwischen FOE, vermutetem FOE und Nicht-FOE unterscheiden.