Zeitschrift für fortgeschrittene Chemieingenieurwesen

Abstrakt

Kristallographische Daten und Modellqualität – über 0,8 Å und unabhängiges Atommodell

Maura Malinska

Bei der routinemäßigen Analyse von Röntgendaten wird üblicherweise das Independent Atom Model (IAM) zur Elektronendichte verwendet. Dieses Modell liefert jedoch keine quantitative Beschreibung der Elektronendichteverteilung, weil Atome als neutral und kugelförmig angenommen werden. Ziel des Projekts ist die Anwendung neuer Methoden, die für die Rekonstruktion der Elektronendichte anhand von CuKα-Röntgenbeugungsdaten entwickelt wurden. Diese Methoden heißen Bond-Oriented Deformation Density Model (BODD). Unsere Studie zeigte Übereinstimmung zwischen den Ergebnissen nach Verfeinerungen anhand von MoKα- und CuKα-Daten. Beobachtete systematische Fehler bei CuKα-Daten sind: systematisch höhere ADPs schwerer Atome und weniger Dichteinformationen in Residualdichtekarten und Diagrammen der fraktalen Dimension. Dies ist auf die Menge der in den CuKα-Daten verfügbaren Informationen zurückzuführen. Zweifellos führt die Verwendung der beschriebenen Methoden zu präziseren und genaueren Endstrukturen im Vergleich zur IAM-Struktur. Wie erwartet sind die HAR- und TAAM-Methoden präziser und genauer als BODD, während BODD schneller und benutzerfreundlicher ist. Die Ergebnisse von HAR und TAAM sind ähnlich. Zur HAR-Verfeinerung empfehlen wir jedoch, die ADPs von Wasserstoffatomen mithilfe des SHADE-Servers zu schätzen.