Zeitschrift für mikrobielle und biochemische Technologie

Abstrakt

Gemeinschaftsanalyse von Ammoniak oxidierenden Bakterien durch Molekulargenetik im Belebtschlamm einer Abwasserbehandlungsanlage

Abgeordneter Shah

Wir untersuchten die Gemeinschaften von Ammoniak oxidierenden Bakterien (AOB) in aktiviertem Schlamm mithilfe der Polymerase-Kettenreaktion (PCR), gefolgt von terminalem Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus (T-RFLP), Klonierung und Sequenzierung der Alpha-Untereinheit des Ammoniak-Monooxygenase-Gens (amoA). In dieser Studie wurden die Techniken der spezifischen Amplifikation von Ammoniak-oxidierenden 16S-rDNA-Fragmenten durch PCR, der Trennung gemischter PCR-Proben durch denaturierende Gradientengelelektrophorese (DGGE) und der Bandenidentifizierung durch spezifische Hybridisierung mit Oligonukleotidsonden kombiniert, um den Vergleich der Gemeinschaftszusammensetzung mehrerer Proben über Raum und Zeit zu ermöglichen. Interessante DGGE-Bänder wurden auch zur DNA-Isolierung, Reamplifikation, Sequenzbestimmung und phylogenetischen Analyse herausgeschnitten. Wir verglichen monatliche Proben des emergenten Makrophyten Glyceria maxima, um die saisonalen Auswirkungen zu bestimmen, die die Pflanzenwurzeln und die Sauerstoffverfügbarkeit auf die vorhandenen β-Untergruppen-Ammoniakoxidiererpopulationen haben könnten. Ebenso wurden fünf Boden- oder Sedimentproben von unterschiedlichen Standorten mit unterschiedlicher Sauerstoffverfügbarkeit verglichen. Obwohl in den untersuchten Proben das Vorhandensein von zwei zuvor definierten Nitrosospira-Sequenzclustern unterschiedlich nachgewiesen werden konnte, gab es keine Hinweise auf eine bestimmte Gruppe, die spezifisch für periodisch anoxische Umgebungen war.