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Abstrakt
Biologische Charakterisierung und genetische Vielfalt indischer Stämme von Ralstonia solanacearum Biovar 3 und 4, die bakterielle Welke an Tomaten verursachen
Dinesh Singh, Shweta Sinha, Garima Chaudhary und Yadav DK
Ralstonia solanacearum Biovar 3 und 4, die die bakterielle Welke der Tomate (Solanum lycopersicum L.) verursachen, sind weltweit ein verheerender bodenbürtiger Pflanzenpathogen. 87 Isolate von R. solanacearum wurden aus verwelkten Tomatenpflanzen in den indischen Bundesstaaten Jammu und Kashmir, Himachal Pradesh, Uttarakhand, Jharkhand und Orissa isoliert und mit traditionellen und molekularen Methoden charakterisiert. Das Biovar von R. solanacearum wurde anhand verschiedener Kohlenstoffquellen bestimmt und zeigte, dass Biovar 3 von R. solanacearum in allen Bundesstaaten Indiens am häufigsten (90,2 %) vorkam, während Biovar 4 in den Bundesstaaten Jharkhand und Himachal Pradesh gefunden wurde. Die phylotypspezifische Multiplex-PCR ordnete alle 87 Isolate von R. solanacearum, die Tomaten infizieren, dem Phylotyp I zu. Zur Untersuchung der genetischen Vielfalt wurden BOX-PCR- und Multilocus-Sequenztypisierungsmethoden verwendet. Amplifikationsprodukte ergaben ein BOX-PCR-Fingerabdruckmuster im Bereich von 500 bp -4 kb und ergaben 23 DNA-Typisierungsgruppen von 87 Isolaten von R. solanacearum mit einem Ähnlichkeitskoeffizienten von 50 %. Im Rahmen der Multilocus-Sequenztypisierung wurden drei Virulenzgene, nämlich hrp (regulatorische Transkriptionsregulierung) und egl (Endoglucanase-Vorläufer) und fli C-Gene von 18 Stämmen von R. solanacearum aus verschiedenen agroklimatischen Zonen, identifiziert. Basierend auf der Sequenzanalyse des egl-Gens waren die meisten indischen Stämme von R. solanacearum einander sehr ähnlich, mit Ausnahme von ORT-8, UTT-23 und JHT2, und einige waren dem Stamm GMI1000 sehr ähnlich. In indischen Isolaten von R. solanacearum wurde unabhängig vom Ort der Isolierung und den klimatischen Bedingungen eine große genetische Variabilität festgestellt.