Ocky Karna Radjasa
Insgesamt wurden 90 Bakterienisolate aus Schwämmen gewonnen, die in den Gewässern von Bandengan, Jepara und auf der Insel Karimun der Karimunjawa-Inseln in der Nordjavasee gesammelt wurden. Ein antibakterielles Screening mithilfe eines pathogenen Escherichia coli ergab, dass zwei Isolate, BSP.12 und MKSP.5, das Wachstum des getesteten Stammes hemmten. Eine molekulare Identifizierung basierend auf einem 16S-rDNA-Ansatz ergab, dass das Isolat BSP.12 eng mit Vibrio harveyi verwandt ist und eine Homologie von 100 % aufweist, während das Isolat MKSP.5 die höchste Ähnlichkeit mit Brachybacterium rhamnosum (99 %) aufweist.
Ein PCR-basierter Ansatz unter Verwendung spezifischer Primer, die auf das Vorkommen von Genfragmenten abzielen, die für die Biosynthese wichtiger Naturprodukte, nämlich nicht-ribosomaler Peptidsynthetasen (NRPS) und Polyketidsynthasen (PKS), erforderlich sind, wurde angewendet, um das genetische Potenzial dieser aktiven Stämme abzuschätzen. Beide Isolate waren in der Lage, die NRPS-Genfragmente zu amplifizieren, nicht jedoch die PKS-Genfragmente.