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Abstrakt
Allelfrequenz und Genotypverteilung von 9 SNPs in der kasachischen Bevölkerung
Aisha N. Iskakova, Aliya A. Romanova, Elena N. Voronina, Nurgul S. Sikhayeva, Liliya A. Belozerceva, Maksim L. Filipenko und Erlan M. Ramanculov
Hintergrund: Die Bestimmung der allelischen Varianten von Genen für die xenobiotische Biotransformation ist wichtig, insbesondere für die Verschreibung personalisierter Medikamente. Kenntnisse über die Allelverteilung in verschiedenen Populationen können bei der Auswahl des bevorzugten Medikamentenschemas berücksichtigt werden. Die Häufigkeit der Gene CYP2C9, VKORC1, CYP4F2, GGCX, CYP2D6 und CYP1A2 wurde in vielen Populationen untersucht, die Populationen in Zentralasien wurden jedoch noch nicht untersucht.
Methoden und Materialien: Mithilfe von Echtzeit-PCR und auf direkter Sequenzierung basierenden Methoden untersuchte die vorliegende Studie die Häufigkeit von 9 Polymorphismen von Genen, die Enzyme kodieren, die am Arzneimittelstoffwechsel beteiligt sind, bei 450 gesunden Personen aus verschiedenen Regionen Kasachstans und 575 gesunden Personen aus der westsibirischen Region Russlands.
Ergebnisse: Die Allelfrequenzen in der kasachischen Bevölkerung wurden für CYP2C9*2 (0,02), CYP2C9*3 (0,03), VKORC1 c. 173+1369G>C, VKORC1 c. bestimmt. 173+1000C>T (0,72, СYP4F2 (0,31), GGCX (0,04), CYP2D6*4 (0,07), CYP2D6*3 (0,01) und CYP1A2*1F (0,35). Alle Allele befanden sich im Hardy-Weinberg-Gleichgewicht (p > 0,05). Die Allelfrequenzen in der russischen Bevölkerung waren wie folgt: CYP2C9*2, 0,08; CYP2C9*3, 0,08; VKORC1 (ca. 173+1000C>T), 0,40; VKORC1 (ca. 173+1369G>C), 0,41; СYP4F2 (ca. 1297G>A), 0,24; GGCX (ca. 1913+45G>C), 0,08; CYP2D6*3, 0,15; CYP2D6*4, 0,22; und CYP1A2*1F (c. -9-154C>A), 0,31. Alle Allele befanden sich im Hardy-Weinberg-Gleichgewicht (p>0,05), außer GGCX (p=0,04).
Schlussfolgerung: Die Allelhäufigkeit der kasachischen Bevölkerung lag bei fast allen untersuchten Genallelvarianten zwischen der der kaukasischen und der asiatischen Bevölkerung.