Zeitschrift für Pflanzenpathologie und Mikrobiologie

Abstrakt

AFLP-Fingerprinting zur Identifizierung von Infra-Artengruppen von Rhizoctonia solani und Waitea circinata

Bimal S. Amaradasa, Dilip Lakshman und Keenan Amundsen

Fleckenkrankheiten , die durch die Sorten Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk und Waitea circinata Warcup und Talbot (Anamorphe: Rhizoctonia-Arten) verursacht werden, stellen eine ernste Bedrohung für die erfolgreiche Erhaltung mehrerer wichtiger Rasengräserarten dar. Sich zur Identifizierung der Rhizoctonia-Erreger auf Feldsymptome zu verlassen, kann schwierig und irreführend sein. Verschiedene Rhizoctonia-Arten und Anastomosegruppen (AGs) reagieren unterschiedlich empfindlich auf üblicherweise verwendete Fungizide und haben auch unterschiedliche, krankheitsfördernde Temperaturbereiche. Deshalb ist die korrekte Identifizierung des ursächlichen Erregers wichtig, um den Krankheitsverlauf vorherzusagen und künftige Entscheidungen zur Krankheitsbekämpfung zu treffen. Die Gruppierung von Rhizoctonia-Arten anhand von Anastomosereaktionen ist schwierig und zeitaufwändig. Die Identifizierung von Rhizoctonia-Isolaten durch Sequenzierung der ITS-Region (Internal Transcribed Spacer) kann unerschwinglich sein. Einige Rhizoctonia- Isolate sind aufgrund des Polymorphismus der ITS-Region schwer sequenzierbar . AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) ist eine zuverlässige und kostengünstige Methode zur Erforschung der genetischen Vielfalt zahlreicher Organismen. Es wurden keine detaillierten Analysen durchgeführt, um die Eignung von AFLP zur Bestimmung des Infraspezies-Levels von Rhizoctonia-Isolaten zu bestimmen. Ziel der vorliegenden Studie war die Entwicklung eines AFLP-Fingerprintings zur Bestimmung des Infraspezies-Levels unbekannter Isolate von R. solani Kühn und W. circinata. 79 zuvor charakterisierte Isolate von R. solani (n=55) und W. circinata (n=24) wurden mit AFLP-Markern analysiert, die von vier Primerpaaren erzeugt wurden. Die ungewichtete Paargruppenmethode mit arithmetischem Mittel (UPGMA) gruppierte R. solani- und W.circinata-Isolate korrekt entsprechend ihrer AG, AG-Untergruppe oder W.circinata-Sorte. Die Hauptkomponentenanalyse (PCA) bestätigte die UPGMA-Cluster. Unseres Wissens ist dies das erste Mal, dass die AFLP-Analyse als Methode zur Entschlüsselung der AG, AG-Untergruppe oder W.circinata-Sorte bei einem breiten Spektrum von Rhizoctonia-Isolaten getestet wurde.