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Abstrakt
Fortschritte bei bioinformatischen Werkzeugen für die Hochdurchsatz-Sequenzierung von DNA-Methylierungsdaten
Jianzhong Su, Dan Huang, Haidan Yan, Hongbo Liu und Yan Zhang
Die DNA-Methylierung spielt eine entscheidende Rolle bei der Regulierung der Genexpression während der Zellentwicklung und -differenzierung. Vor kurzem haben Next-Generation-Sequencing-Technologien (NGS) eine Revolution bei der Untersuchung globaler DNA-Methylierungsprofile ausgelöst. Die Analyse von DNA-Methylierungsmustern auf genomweiter Ebene ist für das Verständnis der zugrunde liegenden Mechanismen der DNA-Methylierung von entscheidender Bedeutung. Hier haben wir mehrere Next-Generation-Sequencing-Techniken in Verbindung mit verschiedenen Vorbehandlungsmethoden (Endonukleaseverdau, Affinitätsanreicherung und Bisulfitumwandlung) überprüft und die entsprechenden bioinformatischen Tools und Ressourcen für die weitere Analyse der DNA-Methylierung zusammengefasst.